El personaje principal del libro es Ian Malcolm, un matemático de mediana edad y un poco explorador. El hombre que organizó la exploración, Richard Levine, es un aventurero rico e imprudente pero muy conocido que gasta mucho de su tiempo y dinero explorando diferentes lugares alrededor del mundo y ayuda en una escuela secundaria a dar a los estudiantes ideas de carreras en ciencia.
Sarah Harding es una zoóloga que fue contratada para posiblemente tratar con algunos de los animales. Jack Thorne es el hombre que fabricó todo el equipo especial que el grupo lleva consigo y los acompañó para ayudar y mostrarles a todos cómo manejar y operar la mayoría de los vehículos.
El libro trata sobre cómo Richard Levine intenta encontrar, y encuentra, la segunda isla de dinosaurios de la corporación InGen que había estado buscando e intentando localizar durante años. La segunda isla está a solo unos cientos de millas de la original, y ambas fueron abandonadas cuando un extraño y trágico incidente dejó a casi todos en ambas islas muertos. No sobrevivieron muchas personas que conocían la segunda isla, por lo que le tomó mucho tiempo encontrar a uno de los antiguos empleados de InGen y lograr que le contara sobre la ubicación de la isla.
Con su información, Levine formó un equipo de cinco personas que lo llevaron a la isla: Ian Malcolm, Sarah Harding, Jack Thorne y Eddie Carr, el principal empleado de Thorne. Iban a partir en dos semanas cuando Thorne descubre que Levine se fue temprano a la isla con el deseo de ser el primero en encontrarla «oficialmente». Él y el pequeño grupo de personas que llevaba consigo fueron atacados y todos, excepto Levine, murieron. Lo encontrarían más tarde. El equipo partió hacia la isla poco después para intentar encontrarlo.
Sin que nadie lo supiera, dos de los estudiantes de Levine en la escuela secundaria donde él ayuda, se colaron en la carga del avión y fueron a la isla con ellos. Sus alumnos de dos estrellas, Kelly y Arby, tenían muchas ganas de ir cuando les dijo que iba a explorar el Caribe hacia una isla desconocida. Casi tan pronto como llegaron a la isla, encontraron a Kelly y Arby y todos se dieron cuenta de que no debían pero que tendrían que quedarse toda la expedición. En ese momento no les importó. Más tarde establecieron una base y tomaron el Explorer que trajeron para explorar los alrededores.
Siguieron un viejo sendero en jeep, pasaron por un nido de Tyrannosaurus Rex y vieron a sus dos dueños, que evitaron con mucho cuidado. Después de abandonar el nido encontraron a Levine que había estado viviendo en los árboles tratando de evitar a las bestias salvajes que querían devorarlo. Luego, regresaron al remolque para tratar sus heridas y esa misma noche regresaron al nido del T-Rex para examinarlo. Los padres se habían ido y los bebés y los óvulos estaban allí solos. Levine fue al nido y miró a los niños pequeños. Tenían cuerpos pequeños con cabezas de gran tamaño pero no eran muy tímidos.
Uno se acercó demasiado a Levine y accidentalmente le pisó el pie. Aterrizó gimiendo de dolor con fuerza y luego escuchó a mamá y papá venir ruidosamente. Agarró al niño, le cerró la boca, se subió al coche y se dirigió rápidamente hacia el remolque. Malcolm sedó al bebé y con la ayuda de Sarah le hizo un yeso especial para la pierna con algunos de los suministros médicos, pero después de que el bebé despertó no estaba contento. Chirrió fuerte durante un rato y los padres llegaron rápidamente.
Casi destruyeron el remolque pero recuperaron a su hijo. Más tarde, el grupo encontró un edificio abandonado que quedó de cuando los dinosaurios estaban realmente controlados y se vieron obligados a permanecer allí. En él había una computadora. Arby, el genio de esto, encontró el antiguo programa en ejecución del sistema. Ahora tenía acceso a las pocas cámaras en funcionamiento que quedaban en la isla y también a algunos mapas detallados. Pasaron dos noches peligrosas allí después de esto, pero en la cuarta noche encontraron una manera de salir de esta trampa mortal.
Después de horas de estudiar los mapas y pensar, lo encontraron. Un pequeño edificio del tamaño de un garaje para dos coches estaba situado junto al río que desembocaba en el océano. Determinaron que se trataba de un cobertizo para botes. Antes de que tuvieran la oportunidad de celebrar e intentar avanzar hacia allí, apareció uno de los ya familiares grupos de aves rapaces. Estaban husmeando alrededor de su camioneta hasta que intentaron entrar al edificio cuando vieron a Thorne. Estaba tratando de cerrar la puerta con llave sin ser detectado, pero no era Ian y Sarah ayudó a sostenerla.
Arby y Sarah buscaban algún tipo de salida oculta o no detectada previamente. Lo encontraron. Era una trampilla debajo del escritorio de la computadora que conducía a un túnel de mantenimiento. Estaba apretado pero estaban afuera. Esperaron hasta que las aves rapaces se fueron hasta que llevaron el explorador ahora destartalado y con poco gas al cobertizo para botes.
Dentro de la vieja y oxidada choza estaba su salvador. Era un barco viejo pero funcional que podían llevar a la isla más cercana de Puerto Cortés. Prácticamente lo único bueno que salió de esto fue que Levine consiguió lo que quería. Arby y él establecieron una conexión desde la computadora del edificio, que tenía acceso a todos los archivos y cámaras de la isla, a la computadora portátil de Levine. Podía ver y grabar todas las imágenes que quisiera hasta que se apagaran todas las cámaras.